由于使用了超促排卵，一个取卵周期可能会获得多个胚胎，胚胎移植后剩余的、质量好的胚胎可以通过冷冻保存起来。以便第一次胚胎移植未能妊娠者，可以再冷冻胚胎解冻后移植，避免多次取卵。胚胎冷冻既减轻了经济负担又增加了受孕机会，对部分因卵巢过度刺激综合征或其它原因不宜进行新鲜胚胎移植的患者，可先行胚胎冷冻，再择期行冻融胚胎移植。但冷冻复苏过程都可能对胚胎造成一定的伤害，不能排除解冻后部分胚胎活力下降，甚至全部失活的可能。